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轉錄調控測序

轉錄組測序利用高通量技術分析特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內所有RNA產物，具有時間、組織和空間特異性，能快速獲取特定狀態(tài)下所有轉錄本的序列和表達信息。該技術深入分析基因表達水平，發(fā)現低豐度基因、新型轉錄本和異構體，有助于解析基因表達調控和探索基因結構變異。泓迅生物依托先進的高通量測序技術和專業(yè)轉錄組分析團隊，提供多種類型的轉錄調控測序服務，全面支持生物學研究需求。

服務優(yōu)勢

個性化分析方案定制
一對一完善的售前售后服務
嚴格質控，快速交付

服務詳情

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分析內容
1. RoI序列統計 2. RoI序列長度分布 3. RoI序列質量分布 4. RoI Number of Passes分布 5. 轉錄本分類 6. 聚類與校正 7. 比對及進一步聚類 8. Known Isoforms注釋匯總 9. Known Isoforms Go注釋統計 10. Known Isoforms KEGG注釋統計 11. Known Isoforms eggNOG注釋統計 12. Novel Isoforms注釋匯總 13. Novel Isoforms NR注釋統計 14. Novel Isoforms GO注釋統計 15. Novel Isoforms KEGG注釋統計	16. Discarded Isoforms eggNOG注釋統計 17. Discarded Isoforms注釋匯總 18. Discarded Isoforms NR注釋統計 19. Discarded Isoforms GO注釋統計 20. Discarded Isoforms KEGG注釋統計 21. Discarded Isoforms eggNOG注釋統計 22. 融合基因分析 23. 基因結構優(yōu)化 24. SNP分析 25. 可變剪切分析 26. 基因表達量統計（結合二代測序數據） 27. 基因表達差異分析（結合二代測序數據） 28. 表達差異基因GO富集分析（結合二代測序數據） 29. 表達差異基因KEGG通路富集分析（結合二代測序數據） 30. 表達差異基因聚類分析（結合二代測序數據）

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分析內容
1. 數據過濾與統計 2. 參考序列比對分析 2.1 比對結果統計 2.2 轉錄組整體質量評估 3. mRNA分析 3.1 mRNA表達分析 3.2 mRNA差異表達分析 3.3 差異mRNAGO和KEGG富集分析 3.4 差異表達基因蛋白互作網絡分析 3.5 外顯子表達差異分析 4. LncRNA靶基因GO富集分析 4.1 lncRNA鑒定 4.2 lncRNA表達分析 4.3 lncRNA差異表達分析 4.4 差異lncRNA靶基因預測 4.5 差異lncRNA靶基因GO和KEGG富集分析 4.6 lncRNA與mRNA比較分析 4.7 差異lncRNA與差異靶基因互作分析	5. circRNA分析 5.1 circRNA識別分析 5.2 circRNA表達定量 5.3 circRNA差異表達分析 5.4 circRNA來源基因的GO和KEGG富集分析 6. miRNA分析 6.1 miRNA表達定量 6.2 miRNA差異表達分析 6.3 miRNA靶基因的GO和KEGG富集分析 6.4 lncRNA與miRNA互作分析 6.5 circRNA與miRNA互作分析 7. 聯合分析 7.1 mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA聯合分析 7.2 mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA基因組圈圖 7.3 組間共有特有差異mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA可視化 7.4 mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA可視化平臺搭建 7.5 mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA共表達網絡分析 8. ceRNA分析

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分析內容
有參考 1. 數據質控及統計 2. 參考基因組比對 3. 定量分析 3.1 定量結果 3.2 表達水平分布 3.3 相關性分析 4. 差異分析 4.1 差異基因 4.2 差異基因火山圖 4.3 差異基因聚類 5. GO/KEGG/Reactome富集分析 5.1 GO功能富集 5.2 通路富集結果 5.3 通路富集柱狀圖與散點圖 5.4 KEGG富集通路圖 5.5 Reactome富集分析 6. 差異可變剪切分析	無參考 1. 數據質控及統計 2. 組裝 3. 定量分析 3.1 定量結果 3.2 表達水平分布 3.3 相關性分析 4. 差異分析 4.1 差異基因 4.2 差異基因火山圖 4.3 差異基因聚類 5. GO/KEGG/Reactome富集分析 5.1 GO功能富集 5.2 通路富集結果 5.3 通路富集柱狀圖與散點圖 5.4 KEGG富集通路圖 5.5 Reactome富集分析

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分析內容
1. 數據過濾與統計 2. 參考序列比對分析 2.1 比對結果統計 2.2 比對結果可視化 2.3 基因組區(qū)域分布 2.4 轉錄組整體質量評估 3. 新轉錄本預測 4. 基因表達量分析 4.1 不同樣品表達量對比 4.2 樣本相關性分析	4.3 樣品主成分分析 5. 基因表達差異分析 5.1 差異表達分析 5.2 組間差異基因venn/花瓣圖 5.3 差異基因表達M-A 圖 5.4 差異基因表達火山圖 5.5 差異基因聚類熱圖 6. 差異基因GO 和KEGG 富集分析 6.1 差異表達基因GO 富集分析 6.2 差異表達基因KEGG 富集分析

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分析內容
1. 數據質控及統計 2. 序列比對與拼接 2.1 Reads與參考基因組比對情況統計 2.2 Reads在染色體上的密度分布情況 2.3 Reads在已知類型的基因分布情況 3. SNP和Indel分析 4. 可變剪切分析 4.1 可變剪切分類和數量統計 4.2 可變剪切結構和表達量統計 5. 轉錄本拼接 6. lncRNA篩選 6.1 LncRNA篩序結果 6.1.1 LncRNA 篩選統計圖 6.1.2 編碼潛能篩選維恩圖 6.2 LncRNA特征分析 6.3 篩選lncRNA分類情況 6.3.1 LncRNA 與 mRNA 的長度比較分析	6.3.2 LncRNA 與 mRNA exon 數目比較 6.3.3 LncRNA 與 mRNA ORF 長度比較 7. 定量分析 7.1 定量結果展示 7.2 不同類型轉錄本表達水平比較 7.3 不同試驗條件下表達水平比較 7.4 樣品間表達相關性檢查 8. 差異表達分析 8 .1 差異表達分析結果 8.2 差異表達轉錄本火山圖 8.3 差異表達轉錄本染色體分布 8.4 差異表達轉錄本聚類分析 9. LncRNA靶向mRNA預測 10. GO富集分析 11. KEGG富集分析 12. 蛋白互作網絡分析

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分析內容
數據質控與統計 2. miRNA預測 3. miRNA 靶基因預測 4. miRNA表達分析 4.1 不同樣品表達量對比 4.2 樣本相關性分析 4.3 樣品主成分分析	5. miRNA 差異表達分析 5.1 miRNA 差異表達分析 5.2 差異 miRNA 火山圖 5.3 差異 miRNA 表達 M-A 圖 5.4 差異 miRNA 聚類熱圖 6. 差異表達 miRNA 靶基因的 GO 和 KEGG 富集分析 6.1 差異表達 miRNA 靶基因 GO 富集分析 6.2 差異表達 miRNA 靶基因 KEGG 富集分析

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分析內容
數據質控與統計 2. miRNA預測 3. miRNA 靶基因預測 4. miRNA表達分析 4.1 不同樣品表達量對比 4.2 樣本相關性分析 4.3 樣品主成分分析	5. miRNA 差異表達分析 5.1 miRNA 差異表達分析 5.2 差異 miRNA 火山圖 5.3 差異 miRNA 表達 M-A 圖 5.4 差異 miRNA 聚類熱圖 6. 差異表達 miRNA 靶基因的 GO 和 KEGG 富集分析 6.1 差異表達 miRNA 靶基因 GO 富集分析 6.2 差異表達 miRNA 靶基因 KEGG 富集分析