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案例研究:質(zhì)粒 DNA 的應(yīng)用

發(fā)布時間:2025-03-18

質(zhì)粒DNA是一種小型的、環(huán)狀的雙鏈DNA 分子,通常存在于細(xì)菌、酵母等微生物中,獨立于宿主細(xì)胞的染色體 DNA 存在。質(zhì)粒DNA 是現(xiàn)代生物學(xué)中不可或缺的多功能工具,可推動遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)、生物技術(shù)等領(lǐng)域的進(jìn)步。隨著新技術(shù)和新方法的出現(xiàn),質(zhì)粒 DNA 的應(yīng)用范圍也在不斷擴大。


質(zhì)粒DNA結(jié)構(gòu)與特點

環(huán)狀結(jié)構(gòu):質(zhì)粒 DNA 通常呈閉合環(huán)狀,少數(shù)為線性。

小型分子:大小范圍從幾千堿基對(bp)到數(shù)十萬堿基對不等。

自主復(fù)制:質(zhì)粒DNA攜帶復(fù)制起點(origin of replication, ori),可以在宿主細(xì)胞內(nèi)獨立復(fù)制。

可攜帶基因:質(zhì)粒可以攜帶額外的基因,如抗生素抗性基因、熒光蛋白基因等,用于篩選或功能研究。


質(zhì)粒DNA 在不同應(yīng)用中的質(zhì)量要求有哪些?

質(zhì)粒DNA 廣泛用于各種應(yīng)用,每種應(yīng)用都有不同的純度和質(zhì)量要求。質(zhì)粒在用于研究、細(xì)胞轉(zhuǎn)染及臨床試驗時,其超螺旋 DNA 比例和內(nèi)毒素含量要求各不相同。


? 研究級質(zhì)粒DNA

應(yīng)用:適用于一般分子生物學(xué)研究,包括克隆、PCR、體外轉(zhuǎn)錄、細(xì)菌轉(zhuǎn)化等實驗。

純度:A260/A280 比率為 1.8-2.0,有效控制蛋白質(zhì)污染;A260/A230 > 2.0,確保無鹽類及有機溶劑殘留。

超螺旋比例:無嚴(yán)格限制,但為保證質(zhì)粒的穩(wěn)定性和表達(dá)效率,建議超螺旋比例> 70%。

內(nèi)毒素水平:通常要求內(nèi)毒素濃度低于0.1-10 EU/μg DNA,具體限值需根據(jù)實驗類型和靈敏度確定。


? 轉(zhuǎn)染級質(zhì)粒DNA

應(yīng)用:用于哺乳動物細(xì)胞的瞬時或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,適用于蛋白質(zhì)表達(dá)、CRISPR基因組編輯或病毒包裝。

純度:高純度,A260/A280比率為1.8-2.0,A260/A230 > 2.0,確保RNA、蛋白質(zhì)和鹽污染最小。

超螺旋比例:優(yōu)選超螺旋比例≥80%的質(zhì)粒,較高的超螺旋比例有助于提高轉(zhuǎn)染效率和細(xì)胞內(nèi)的穩(wěn)定性。

內(nèi)毒素水平:內(nèi)毒素水平通常要求小于0.1 EU/μg,某些高靈敏度應(yīng)用甚至要求更低(如≤0.005 EU/μg)。內(nèi)毒素濃度過高會引發(fā)炎癥反應(yīng),降低轉(zhuǎn)染效率。


GMP 級/臨床級質(zhì)粒 DNA

應(yīng)用:用于基因治療、疫苗生產(chǎn)、CAR-T 細(xì)胞治療及臨床試驗,需嚴(yán)格符合《藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范》(GMP)要求。

純度:超純質(zhì)粒,A260/A280 比率為 1.8-2.0,A260/A230 > 2.0,確保無蛋白質(zhì)、RNA、鹽類及有機溶劑殘留。

超螺旋比例:≥90%,高超螺旋比例可提高質(zhì)粒在治療應(yīng)用中的穩(wěn)定性和功能性。

內(nèi)毒素水平:<0.1 EU/μg,部分高靈敏度應(yīng)用要求 <0.01 EU/μg,以滿足臨床安全性和有效性要求。


案例研究:質(zhì)粒DNA 的應(yīng)用

在科研探索中,精準(zhǔn)可靠的技術(shù)支持合作伙伴是取得突破性成果的關(guān)鍵之一。我們非常榮幸與您分享由泓迅生物(Synbio Technologies)提供的質(zhì)粒DNA制備服務(wù)助力的研究成果。


2024年9月12日,中國藥科大學(xué)戴岳教授和夏玉鳳教授帶領(lǐng)的研究團隊在《FASEB Journal》上發(fā)表重要研究成果。


文獻(xiàn)名稱:Bergenin, the main active ingredient of Bergenia purpurascens, attenuates Th17 cell differentiation by downregulating fatty acid synthesis

發(fā)表期刊:《FASEB Journal》

影響因子:14.7

合作單位:中國藥科大學(xué) 

泓迅提供的服務(wù)內(nèi)容:質(zhì)粒制備 

主要內(nèi)容:

Bergenin是藥用植物Bergenia purpurascens的主要活性成分,長期以來被用于治療多種Th17細(xì)胞相關(guān)疾病,如變應(yīng)性氣道炎癥和結(jié)腸炎。該研究從細(xì)胞代謝的角度揭示Bergenin阻礙Th17細(xì)胞反應(yīng)的潛在機制。在體外實驗中,Bergenin治療降低了小鼠初始CD4+T細(xì)胞產(chǎn)生Th17細(xì)胞的數(shù)量。其機制在于巖白菜素可通過限制組蛋白H3K27 在 SREBP1 啟動子區(qū)的乙酰化水平,進(jìn)而下調(diào)關(guān)鍵脂質(zhì)代謝調(diào)控因子 SREBP1 的表達(dá),從而抑制脂肪酸的合成,阻礙 Th17 細(xì)胞的正常分化。此外,該研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),Bergenin 可直接與 SIRT1 相互作用并激活其功能,而 SIRT1 的活化在抑制 FAS 和 Th17 細(xì)胞分化中起到了至關(guān)重要的作用。最后該研究團隊在葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠模型中驗證了 Bergenin 的治療潛力,表明其通過 SIRT1 依賴性途徑有效抑制了 Th17 細(xì)胞的響應(yīng),為未來 Th17 相關(guān)疾病的治療提供了新的思路。


Plasmid DNA application 2

鏈接:https://doi.org/10.1016/j.apsb.2024.11.014


我們?yōu)樵撗芯繄F隊提供了SREBP1相關(guān)的質(zhì)粒,協(xié)助研究者進(jìn)行基因功能的驗證,助力于相關(guān)的機制機理的研究分析。


同年11月26日,該研究團隊在《Advanced Pharmaceutical Sciences and Biotechnology》上也發(fā)表一項重要研究成果。


文獻(xiàn)名稱:Facilitation of mucosal healing by estrogen receptor β in ulcerative colitis through suppression of branched-chain amino acid transport and subsequent triggering of autophagy in colonic epithelial cells

發(fā)表期刊:《Advanced Pharmaceutical Sciences and Biotechnology》

影響因子:4.4

合作單位:中國藥科大學(xué) 

泓迅提供的服務(wù)內(nèi)容:質(zhì)粒制備


主要內(nèi)容:該研究首次揭示了雌激素受體β(ERβ)在結(jié)腸上皮細(xì)胞中的激活程度與潰瘍性結(jié)腸炎(UC)患者粘膜愈合之間存在正相關(guān)關(guān)系。研究表明,ERβ的激活促進(jìn)了結(jié)腸上皮細(xì)胞的自噬過程,抑制了分支鏈氨基酸的轉(zhuǎn)運,從而激活了焦點黏附激酶(FAK),加速了上皮細(xì)胞的遷移和粘膜愈合。此外,ERβ?/?小鼠的潰瘍性結(jié)腸炎模型顯示其愈合能力較野生型小鼠顯著受損,進(jìn)一步證實了ERβ在腸道修復(fù)中的關(guān)鍵作用。研究還發(fā)現(xiàn),ERβ激動劑與常用的UC治療藥物5-氨基水楊酸(5-ASA)的聯(lián)用,可以增強其抗結(jié)腸炎的效果,為潰瘍性結(jié)腸炎的治療提供了新的思路。


Plasmid DNA application 1

文獻(xiàn)鏈接https://doi.org/10.1016/j.apsb.2024.11.014


我們?yōu)樵撗芯繄F隊提供了paxillin-pmCherry和pmCherry-EGFP-Light chain 3 (LC3)質(zhì)粒,助力研究者在活細(xì)胞中實時監(jiān)測并分析焦點粘附轉(zhuǎn)運的情況。在Focal adhesion turnover assay實驗中,主要通過使用帶有熒光標(biāo)記的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞,結(jié)合LMS800共聚焦熒光顯微鏡對細(xì)胞的粘附點進(jìn)行實時追蹤和成像。該實驗重點是觀察焦點黏附點(focal adhesion, FA)在細(xì)胞遷移過程中如何組裝與解體。該質(zhì)粒在實驗中的應(yīng)用可以使研究人員直觀地觀察焦點黏附點的動態(tài)變化,這為揭示ERβ在結(jié)腸粘膜修復(fù)中的機制提供了有力支持。


通過這兩篇文獻(xiàn)我們可以了解到,質(zhì)粒DNA不僅可以用于基因功能的驗證,對代謝機理的研究,帶熒光的融合蛋白質(zhì)粒構(gòu)建還可以用于活細(xì)胞中的定位和觀測。此外,豐富的質(zhì)粒載體還可以用于蛋白的表達(dá),穩(wěn)轉(zhuǎn)株/工程菌的構(gòu)建,病毒包裝,mRNA的合成和疫苗研發(fā),以及用于細(xì)胞基因治療等多個領(lǐng)域。


我們相信,文獻(xiàn)的突破性研究不僅為潰瘍性結(jié)腸炎治療提供了新的視角,也能為您的科研工作帶來新的啟發(fā)。泓迅生物會繼續(xù)致力于為全球科研工作者提供領(lǐng)先的基因合成和合成生物學(xué)等服務(wù),助力科學(xué)突破。


泓迅生物讓科研更高效,讓突破更快速

泓迅生物致力于為全球科研人員提供高質(zhì)量的技術(shù)服務(wù)與DNA解決方案,推動生物技術(shù)領(lǐng)域的創(chuàng)新與發(fā)展。服務(wù)涵蓋序列AI設(shè)計、引物/探針合成、基因合成、RNA合成、文庫合成、多肽合成DNA測序、重組抗體及蛋白表達(dá)、病毒包裝、基因編輯等。我們已為生命科學(xué)研究、合成生物學(xué)開發(fā)、抗體藥物篩選、疫苗研發(fā)、分子育種及DNA信息儲存等領(lǐng)域提供強有力的支持。


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